От вьюнов рода Misgurnus отличается более коротким телом и местоположении спинного плавника. У карликового вьюна он находится почти по центру туловища, чуть сдвинут в сторону хвостового плавника. Кроме этого, хвостовой стебель имеет хорошо заметное жировое утолщение. В остальном, имеет 5 пар усиков, мелкую чешую под толстым слоем слизи. Вырастает до 10 см